Na casa de Ivan Petrovich Shuisky, na presença de muitos clérigos e alguns boiardos, eles decidem divorciar Fyodor Ioannovich com a czarina, irmã de Godunova, graças a quem, segundo todos os relatos, Boris é mantido. Eles compõem um jornal, onde, lembrando a esterilidade da rainha e a infância de Demétrio, pedem ao rei que entre em um novo casamento. Golovin sugere Shuisky sobre a possibilidade de colocar Demétrio no lugar de Fedor, mas recebe uma recusa severa. A princesa Mstislavskaya leva os hóspedes, bebe a saúde de Fedor. Shakhovsky, noivo de Mstislavskaya, casamenteiro Volokhov chama o local da reunião secreta. Ivan Petrovich envia uma petição ao Metropolitan, lamentando a necessidade de destruir a rainha. Fedyuk Starkov, seu mordomo, relata o que Godunov viu. Tendo recebido de Uglich informações sobre o relacionamento de Golovin com Nagimi e vendo uma ameaça ao seu poder, ele anuncia a seus apoiadores, Lup-Kleshnin e Príncipe Turenin, a decisão de reconciliar-se com Shuisky. Fyodor chega, reclamando de um cavalo empapado. A rainha Irina aparece, a quem Fedor maliciosamente relata sobre a beleza Mstislavskaya, a quem ele viu na igreja, e imediatamente garante à rainha que ela é mais bonita por ele do que todos os outros. Godunov fala de um desejo de chegar a um acordo com Shuisky, e o czar retoma o assunto com prazer.
Fedor anuncia sua intenção de conciliar Godunov com Shuisky e pede ajuda ao Metropolitano Dionísio e outros clérigos. Dionísio acusa Godunov de oprimir a igreja, indulgente com os hereges e retomar a cobrança de impostos dos quais a igreja foi libertada. Godunov apresenta-lhe cartas e relatórios protetores sobre a perseguição à heresia realizada. O rei está pedindo apoio a Irina e aos boiardos. Acompanhado pelo entusiasmo popular, Ivan Petrovich Shuisky vem. Fedor o repreende por não ter visitado a Duma, Shuisky fica desencorajado pela impossibilidade de concordar com Godunov. Fyodor, lembrando-se das Escrituras e chamando clérigos para testemunhas, fala dos benefícios da reconciliação, e Godunov, obediente a ele, oferece consentimento a Shuisky. Shuisky o censura por não querer compartilhar a administração do estado, que John legou a cinco boiardos: Zakharyin (falecido), Mstislavsky (com força de tonsura), Belsky (exilado), Godunov e Shuisky. Godunov, justificando-se, fala da arrogância de Shuisky, de que ele usou o único poder em benefício da Rússia, o que também é provado por; ele acrescenta que a difícil tarefa de colocar um estado frustrado em ordem era apenas Shuysky. E quando Ivan Petrovich chama seu partidário de Metropolitan, ele relata as ações de Godunov em favor da igreja e convence Shuisky à paz. Irina, mostrando sua capa bordada para o santuário de Pskov, admite que este é seu voto de oração pela salvação de Shuisky, uma vez sitiada pelos lituanos em Pskov. Um Shuisky empolgado está pronto para esquecer a antiga inimizade, mas exige de Godunov garantias de segurança para seus associados. Godunov jura e beija a cruz. Eles convidam os eleitos da multidão trazida por Shuisky. Fyodor fala com o velho e não sabe como detê-lo. No sobrinho, ele reconhece o comerciante Krasilnikov, que o divertia recentemente com uma briga de urso, lembra seu irmão Golub, que derrotou Shakhovsky em socos - Godunov e Shuisky não conseguiram devolver imediatamente o czar ao que os eleitores eram chamados. . Shuisky anuncia uma reconciliação com Godunov, os comerciantes estão preocupados ("Você está reconciliando nossas cabeças"), Shuisky fica irritado com sua desconfiança em relação à pessoa que acabou de jurar na cruz. Os comerciantes pedem proteção contra Godunov, o rei, mas ele os envia para Boris. Boris ordena silenciosamente que anote os nomes dos comerciantes.
À noite, no jardim da princesa Shuisky Mstislavskaya e Vasilisa Volokhova, espere Shakhovsky. Ele vem, fala sobre amor, sobre a impaciência com que o casamento aguarda, ri e brinca com ela. Krasilnikov vem correndo, deixando entrar, Shakhovsky se esconde, chama Ivan Petrovich e relata que todos que estavam com o czar foram capturados pela ordem de Godunov. Shuisky, chocado, ordena que Moscou suba para Godunov. Ele deu a entender que Dimitri Golovin se interrompeu abruptamente e, dizendo que Boris havia se enganado, foi ao czar. Os boiardos restantes, enquanto isso, estão discutindo a petição, procurando uma nova rainha. Vasily Shuisky liga para a princesa Mstislavskaya. Seu irmão não decidiu imediatamente, querendo encontrar pelo menos um motivo para uma briga com Shakhovsky. Enquanto ele hesita, Golovin escreve o nome da princesa em uma petição. Shakhovskaya aparece, declarando que não vai desistir da noiva. A princesa e Volokhova também são encontrados. Com um grito geral, ameaças e censuras mútuas, Shakhovskaya pega uma carta e foge. Godunov apresenta aos documentos do estado czar, cujo conteúdo ele não aborda, mas concorda com as decisões de Boris. Tsarina Irina fala de uma carta de Uglich da rainha viúva com um pedido para retornar com Dimitri a Moscou. Fyodor estava confiando o caso a Boris, mas Irina exigiu a solução do "caso de família" dele; Fedor discute com Boris e fica irritado com sua tenacidade. Shuisky vem, reclama de Godunov. Ele não abre, explicando que os comerciantes não foram levados para o passado, mas por tentar perturbar o mundo entre ele e Shuisky. O czar está pronto para perdoar Godunov, acreditando que eles simplesmente não se entendiam, mas a incansável exigência de deixar o príncipe em Uglich está finalmente zangada com o czar. Godunov diz que está dando lugar a Shuisky, Fedor pede que ele fique, Shuisky, ferido pelo comportamento do czar, sai. Kleshnin traz a carta de Golovin Nagim enviada de Uglich, Godunov a mostra ao czar, exigindo que Shuisky seja preso e, possivelmente, executado. Em caso de falha, ele ameaça sair. Chocado Fedor, após longa hesitação, recusa os serviços de Godunov.
Ivan Petrovich Shuisky consola a princesa Mstislavskaya: ele não permitirá que ela se case com o czar e espera que Shakhovskaya não os informe. Enviando para a princesa, ele aceita os boiardos e os fugitivos Krasilnikov e Dove e, assumindo a remoção do empobrecido Fedor e a entronização de Demétrio, define as tarefas de todos. O distante Godunov, sentado em casa, pergunta a Kleshnin sobre Volokhova e repete muitas vezes: "para que ela prostituísse o príncipe". Kleshnin envia Volokhov para UGLICH uma nova mãe, ordena que ele seja protegido e sugere que se o príncipe que sofre de um arroz se matar, eles não perguntarão a ela. Enquanto isso, Fedor não consegue descobrir os papéis apresentados a ele. Kleshnin chega e relata que Boris ficou doente de frustração, e Shuisky deve ser imediatamente preso por sua intenção de elevar Demétrio ao trono. Fedor não acredita. Shuisky entra, a quem Fedor fala de uma denúncia e pede que ele se justifique. O príncipe se recusa, o rei insiste, Kleshnin empurra. Shuisky confessa a rebelião. Fyodor, com medo de que Godunov punisse Shuisky por traição, declara que ele mesmo ordenou que o príncipe subisse ao trono e expulsou Shuisky da sala. Shakhovskaya explode nas câmaras reais e pede para devolver a noiva para ele. Fedor, vendo a assinatura de Ivan Petrovich Shuisky, chora e não escuta os argumentos de Irina sobre o absurdo do jornal. Protegendo Irina de insultos, ele assina a ordem de Borisov, aterrorizando ela e Shakhovsky. Na ponte sobre o rio, o velho revolta o povo por Shuisky, o hussardo canta sobre sua coragem. Um mensageiro acompanha as notícias do avanço dos tártaros. O príncipe Turenin com arqueiros leva Shuisky à prisão. O povo, derrubado pelo velho, quer libertar Shuisky, mas ele fala de sua culpa diante do rei "santo" e de que merece punição.
Kleshnin relata a Godunov que os Shuiskys e seus apoiadores estão presos e apresenta Vasily Ivanovich Shuisky. Ele vira a questão como se tivesse iniciado uma petição pelo bem de Godunov. Compreendendo que Shuisky está em suas mãos, Godunov o deixa ir. Tsarina Irina vem interceder por Ivan Petrovich. Godunov, percebendo que Shuisky não vai parar de discutir com ele, é inflexível. Na praça em frente à catedral, os mendigos falam de uma mudança no metropolitano que é censurável a Godunov, sobre a execução de comerciantes que estavam atrás de Shuisky. Tsarina Irina leva Mstislavskaya para pedir Shuisky. Fedor sai da catedral, tendo servido um requiem para o czar Ivan. A princesa corre aos seus pés. Fedor envia o príncipe Turenin para Shuisky. Mas Turenin relata que Shuisky se estrangulou à noite, se culpa por ignorar (porque espancou a multidão trazida à prisão por Shakhovsky e só espancou atirando em Shakhovsky). Fedor corre para Turenin, acusando-o de matar Shuisky, e o ameaça com execução. O mensageiro traz uma carta de Uglich sobre a morte do príncipe. O rei chocado quer descobrir a verdade ele mesmo. Chega uma mensagem sobre a abordagem do Khan e o cerco inicial de Moscou. Godunov oferece enviar Kleshnin e Vasily Shuisky, e Fedor está confiante na inocência de Godunov. A princesa Mstislavskaya diz que pretende cortar o cabelo. Fedor, seguindo o conselho de sua esposa, entregará todo o ônus do governo a Boris e, lembrando-se de sua intenção de "concordar com tudo, suavizar tudo", lamenta seu destino e seu dever real.